RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC169A6NNP5 214 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ASAP2O43150 1006 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 HBP1O60381 514 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ATP4AP20648 1035 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 KRT9P35527 623 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ARL2P36404 184 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 NPTX2P47972 431 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PEX3P56589 373 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 IER5Q5VY09 327 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 C17orf99Q6UX52 265 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 USP37Q86T82 979 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM139Q8IV31 216 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GLG1Q92896 1179 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 BORCS6Q96GS4 357 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 MAML3Q96JK9 1138 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SPATA33Q96N06 139 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 DNAJC7Q99615 494 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TBX20Q9UMR3 447 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.22□□□□□ -1.09
SEC31A-241ENST00000515749 TTC26A0AVF1 554 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 22.2
SEC31A-241ENST00000515749 PMM2O15305 246 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 P4HA2O15460 535 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 MAGEB2O15479 319 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 EXOC3O60645 756 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 AKAP3O75969 853 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 ARIH2O95376 493 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 KRT13P13646 458 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 GARTP22102 1010 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 NAMPTP43490 491 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 EFNA5P52803 228 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 TERF1P54274 439 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 PRR20EP86478 221 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 PRR20CP86479 221 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 PRR20DP86480 221 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 PRR20BP86481 221 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 PRR20AP86496 221 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 SP4Q02446 784 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 CETN1Q12798 172 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 KCNH2Q12809 1159 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 MAP2K5Q13163 448 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 ACVR2BQ13705 512 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 EMC2Q15006 297 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 MTERF2Q49AM1 385 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 CEP135Q66GS9 1140 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 NEK11Q8NG66 645 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 PPTC7Q8NI37 304 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 CEP89Q96ST8 783 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 PCYT2Q99447 389 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 POLD4Q9HCU8 107 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.21□□□□□ -1.1
SEC31A-241ENST00000515749 MYO6Q9UM54 1294 aa8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms