RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 PARD6AQ9NPB6 346 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 CEP131Q9UPN4 1083 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 NUMBLQ9Y6R0 609 aa17.54■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 COL4A3Q01955 1670 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 ANHXE9PGG2 379 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 C2CD2LO14523 706 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 TBC1D4O60343 1298 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 RFPL2O75678 378 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 SEC24BO95487 1268 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 ADH1AP07327 375 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 DARSP14868 501 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 RXRAP19793 462 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 TGM1P22735 817 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 PHKA2P46019 1235 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 AK2P54819 239 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 BRF1Q92994 677 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa17.53■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 LILRB3O75022 631 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 LILRB5O75023 590 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 PLEKHA8P1O95397 391 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 GLUD1P00367 558 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 URODP06132 367 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 KCNA4P22459 653 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 GPC3P51654 580 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 GPC5P78333 572 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 RTN1Q16799 776 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 TMTC3Q6ZXV5 915 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 NETO1Q8TDF5 533 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 NLRP7Q8WX94 980 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 PHKBQ93100 1093 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 PGBD1Q96JS3 809 aa17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
ZBED1-205ENST00000515319 DOCK6Q96HP0 2047 aa17.52■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 FAM170BA6NMN3 283 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 GOLGA8BA8MQT2 603 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 MEIS1O00470 390 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SLC30A4O14863 429 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF76P36508 570 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 MAGEA9P43362 315 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 EVCP57679 992 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SPEM2Q0P670 501 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 CHST12Q9NRB3 414 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 PDRG1Q9NUG6 133 aa17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 TEX28O15482 410 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SKIP12755 728 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 PRKCQQ04759 706 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 TSSK4Q6SA08 328 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF280BQ86YH2 543 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 LINC01465Q8N7H1 131 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 URGCPQ8TCY9 931 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 RPS6KC1Q96S38 1066 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 OSBPL6Q9BZF3 934 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 RAB23Q9ULC3 237 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa17.5■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 MEIS3P2A8K0S8 358 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 B4GALT3O60512 393 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 OFD1O75665 1012 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SOD2P04179 222 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ALDH2P05091 517 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SPATA31D3P0C874 917 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 NELL1Q92832 810 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 FAM167AQ96KS9 214 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 FAN1Q9Y2M0 1017 aa17.49■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ACAP1Q15027 740 aa17.48■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ANKRD1Q15327 319 aa17.48■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 SLC44A4Q53GD3 710 aa17.48■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.48■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 PLA2G4DQ86XP0 818 aa17.48■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 FGF14Q92915 247 aa17.48■□□□□ 0.39
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms