RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SHEQ5VZ18 495 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 C8orf74Q6P047 294 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TTLQ8NG68 377 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SPATA18Q8TC71 538 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 JDP2Q8WYK2 163 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KLHL29Q96CT2 875 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF333Q96JL9 665 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 VPS35Q96QK1 796 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PANX2Q96RD6 677 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SFI1A8K8P3 1242 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 A8MX80 341 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TBX3O15119 743 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TLR2O60603 784 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GNRH1P01148 92 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HSPA6P17066 643 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RXRBP28702 533 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 STK3Q13188 491 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 DSC3Q14574 896 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 Q3ZCU0 254 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 IFT20Q8IY31 132 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RAB17Q9H0T7 212 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 AFF2P51816 1311 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 INMTO95050 263 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RETP07949 1114 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TPBGLP0DKB5 382 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RARBP10826 455 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NCAM1P13591 858 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 VHLP40337 213 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RTP1P59025 263 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GSTO1P78417 241 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 OCRLQ01968 901 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CHRNEQ04844 493 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 QPCTQ16769 361 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 USP43Q70EL4 1123 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GIPC3Q8TF64 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 IFT52Q9Y366 437 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ABCC2Q92887 1545 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 H3BUI4 141 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PRMT3O60678 531 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SLC4A1P02730 911 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MYZAPP0CAP1 466 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NCALDP61601 193 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PLCB3Q01970 1234 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MOGSQ13724 837 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 Q3C1V9 767 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ANO1Q5XXA6 986 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 EMBQ6PCB8 327 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NME9Q86XW9 330 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TTC25Q96NG3 672 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TESK2Q96S53 571 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NEURL2Q9BR09 285 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NUP85Q9BW27 656 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CDH19Q9H159 772 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.59□□□□□ -1.35
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