RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 LIG1P18858 919 aa23.29■■□□□ 1.32
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SH3BP2-210ENST00000505941 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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SH3BP2-210ENST00000505941 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.29■■□□□ 1.32
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SH3BP2-210ENST00000505941 RNF19AQ9NV58 838 aa23.29■■□□□ 1.32
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SH3BP2-210ENST00000505941 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.28■■□□□ 1.32
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SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.28■■□□□ 1.32
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SH3BP2-210ENST00000505941 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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SH3BP2-210ENST00000505941 FZD8Q9H461 694 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 POLD4Q9HCU8 107 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-210ENST00000505941 SPG21Q9NZD8 308 aa23.27■■□□□ 1.32
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SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GUA9 196 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 N4BP3O15049 544 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 HIP1RO75146 1068 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 OFD1O75665 1012 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 CSPG5O95196 566 aa23.26■■□□□ 1.31
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SH3BP2-210ENST00000505941 ASB2Q96Q27 587 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.26■■□□□ 1.31
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SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNK18Q7Z418 384 aa23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP2-210ENST00000505941 LZTS1Q9Y250 596 aa23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 HCSTQ9UBK5 93 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 NR1I2O75469 434 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 ALDH2P05091 517 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 NPTX2P47972 431 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC39A14Q15043 492 aa23.23■■□□□ 1.31
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