RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 DPF2Q92785 391 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 NUDT11Q96G61 164 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 NTMQ9P121 344 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SYNJ1O43426 1573 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 FSBPO95073 299 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 KRT18P05783 430 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 COL6A1P12109 1028 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 PDCP20941 246 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 AKAP5P24588 427 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 RRADP55042 308 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 CD69Q07108 199 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF385BQ569K4 471 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 MCTP2Q6DN12 878 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 COA7Q96BR5 231 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 UIMC1Q96RL1 719 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SOX7Q9BT81 388 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 GREM2Q9H772 168 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1B0GTL3 188 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC154A6NI56 674 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 AKR1B10O60218 316 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 DTNBO60941 627 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 CAND2O75155 1236 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL18O94889 574 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 LY86O95711 162 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 POU2F2P09086 479 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 MYBP10242 640 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF28P17035 718 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 GNALP38405 381 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ADAM15Q13444 863 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 PRR31Q5SQ13 230 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 KSR2Q6VAB6 950 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 RELTQ969Z4 430 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 AIFM3Q96NN9 605 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 MAP3K14Q99558 947 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA25Q9BR10 227 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 OBP2AQ9NY56 170 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 MCAMP43121 646 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ETV4P43268 484 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 PER3P56645 1201 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 VMACQ2NL98 169 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 LILRA6Q6PI73 481 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 Q6ZUG5 572 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 USP45Q70EL2 814 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 GPR156Q8NFN8 814 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 PBRM1Q86U86 1689 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1B-215ENST00000498054 ABCC8Q09428 1581 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MED14OSP0DP75 135 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 MRE11P49959 708 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-215ENST00000498054 PCOLCEQ15113 449 aa5.52□□□□□ -1.53
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