RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP72	Q9P209	647 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SRRD	Q9UH36	339 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	EXTL3	O43909	919 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TOM1L1	O75674	476 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	C22orf31	O95567	290 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CYBA	P13498	195 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	KLRC1	P26715	233 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CLCN1	P35523	988 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT9	P35527	623 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	FLT3LG	P49771	235 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	LIG4	P49917	911 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SYCP1	Q15431	976 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GPD1L	Q8N335	351 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC35C1	Q96A29	364 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	FZD8	Q9H461	694 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	RNF186	Q9NXI6	227 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GPR25	O00155	361 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	FKTN	O75072	461 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HMGCR	P04035	888 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GYPC	P04921	128 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	RARB	P10826	455 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	AXL	P30530	894 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HOXC8	P31273	242 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CASP14	P31944	242 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	VAMP7	P51809	220 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CLDN10	P78369	228 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CCZ1B	P86790	482 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	RBL2	Q08999	1139 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	KCNA1	Q09470	495 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CAPS	Q13938	189 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MEA1	Q16626	185 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SESTD1	Q86VW0	696 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	BICD1	Q96G01	975 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A0B4J269	797 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TTC26	A0AVF1	554 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM150B	A6NC51	233 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CLIC2	O15247	247 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CLDN3	O15551	220 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GFPT2	O94808	682 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP2C19	P33261	490 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	FMO5	P49326	533 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PSEN2	P49810	448 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT83	P78385	493 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAM17	P78536	824 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77

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