RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 C2orf71A6NGG8 1288 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 GALTP07902 379 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 GLRA2P23416 452 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 MBTD1Q05BQ5 628 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF280BQ86YH2 543 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 C4orf32Q8N8J7 132 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 VN1R3Q9BXE9 311 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 S1PR5Q9H228 398 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-211ENST00000490677 TECTAO75443 2155 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 NCLP19338 710 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF174Q15697 407 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 SYCE2Q6PIF2 218 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 TMC7Q7Z402 723 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 PGBD4Q96DM1 585 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 IGSF21Q96ID5 467 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 NFKBIZQ9BYH8 718 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 ZBP1Q9H171 429 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 TUFT1Q9NNX1 390 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 DCXO43602 365 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 DDHD2O94830 711 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
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HOXB3-211ENST00000490677 LOC730098B7Z3J9 87 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 OR52Z1P0C646 297 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 ALADP13716 330 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 TECP42680 631 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 SLC11A1P49279 550 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD54Q6NXT1 300 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM169Q96HH4 297 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 RSAD1Q9HA92 442 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 GPRC5CQ9NQ84 441 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 INPPL1O15357 1258 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 AXLP30530 894 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 TFDP1Q14186 410 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 TTC38Q5R3I4 469 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 CPB2Q96IY4 423 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 RNF39Q9H2S5 420 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 IPPQ9Y573 584 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 IRAK3Q9Y616 596 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 DENND4AQ7Z401 1863 aa30.91■■■□□ 2.54
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HOXB3-211ENST00000490677 ERLIN2O94905 339 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
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HOXB3-211ENST00000490677 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 POTEGQ6S5H5 508 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 RNF135Q8IUD6 432 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 VPS52Q8N1B4 723 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 PLXNA3P51805 1871 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF318Q5VUA4 2279 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 TRIP11Q15643 1979 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 C2orf16Q68DN1 1984 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 TRAPPC10P48553 1259 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 LLGL2Q6P1M3 1020 aa30.89■■■□□ 2.54
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HOXB3-211ENST00000490677 AUTS2Q8WXX7 1259 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC51Q96ER9 411 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 GBP3Q9H0R5 595 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 CSRNP2Q9H175 543 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB3-211ENST00000490677 B4GALT5O43286 388 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 CTSAP10619 480 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 ECM1Q16610 540 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
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HOXB3-211ENST00000490677 MUTYHQ9UIF7 546 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 HES2Q9Y543 173 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 MYO10Q9HD67 2058 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 CARNS1A5YM72 827 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 PRR33A8MZF0 331 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 CXCL14O95715 111 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 FAM184AQ8NB25 1140 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 URGCPQ8TCY9 931 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 NACC1Q96RE7 527 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 POMCP01189 267 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 BSNDQ8WZ55 320 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
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