RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TXNDC9O14530 226 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 RHOBTB3O94955 611 aa18.18■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 KIF12Q96FN5 646 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TTC25Q96NG3 672 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 HAUS8Q9BT25 410 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 FTLP02792 175 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 CYFIP1Q7L576 1253 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 POLD4Q9HCU8 107 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 A8MXQ7 604 aa18.18■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 STILQ15468 1287 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 PDXDC1Q6P996 788 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 ADGRG1Q9Y653 693 aa18.18■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.17■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 CETPP11597 493 aa18.17■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 EXOC4Q96A65 974 aa18.17■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 MXRA8Q9BRK3 442 aa18.17■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 ADSSL1Q8N142 457 aa18.17■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 RFFLQ8WZ73 363 aa18.17■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.17■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 TRIM49CP0CI26 452 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 CCT5P48643 541 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 DPYDQ12882 1025 aa18.16■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 PARVAQ9NVD7 372 aa18.16■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 TTC4O95801 387 aa18.16■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 SLC4A1P02730 911 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 CHRNA3P32297 505 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 HVCN1Q96D96 273 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 LRGUKQ96M69 825 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.16■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 FOXN1O15353 648 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 NR1D1P20393 614 aa18.16■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 TEX33O43247 280 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.55e-6■□□□□ 8.9
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NISCH-213ENST00000489895 GDAP1Q8TB36 358 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 PGBD4Q96DM1 585 aa18.15■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 KRT38O76015 456 aa18.15■□□□□ 0.5
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NISCH-213ENST00000489895 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 RBP5P82980 135 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.15■□□□□ 0.5
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