RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 PRKCBP05771 671 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 SCP2P22307 547 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 ARSHQ5FYA8 562 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 TMEM192Q8IY95 271 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 HACE1Q8IYU2 909 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.61■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 A0A1B0GUA9 196 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 K7ERI5 159 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 RB1P06400 928 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 FGFR1P11362 822 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 EPC2Q52LR7 807 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 SV2BQ7L1I2 683 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 LRRC15Q8TF66 581 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 PLVAPQ9BX97 442 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 CUEDC2Q9H467 287 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 POLD4Q9HCU8 107 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.6■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 N4BP3O15049 544 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 FAM13AO94988 1023 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 BMPR1AP36894 532 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 UBXN11Q5T124 520 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 LRRC43Q8N309 656 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 CPB2Q96IY4 423 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 SPATA32Q96LK8 384 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 REEP2Q9BRK0 252 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 PARVGQ9HBI0 331 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 AAASQ9NRG9 546 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 MYO9BQ13459 2157 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 B4GALT5O43286 388 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 ABCD1P33897 745 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 CTNNB1P35222 781 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 GATMP50440 423 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 SHC4Q6S5L8 630 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 IQUBQ8NA54 791 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 CASD1Q96PB1 797 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.58■■□□□ 1.21
NOM1-208ENST00000489850 TRANK1O15050 2925 aa22.58■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 CARNS1A5YM72 827 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 EPOPA6NHQ4 379 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 SFI1A8K8P3 1242 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 LIG1P18858 919 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 ZNF131P52739 623 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 GIT2Q14161 759 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 SPRED2Q7Z698 418 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 PDILTQ8N807 584 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 RNF19AQ9NV58 838 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 IPPQ9Y573 584 aa22.57■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 H3BNC9 293 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 SLC16A4O15374 487 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 LINC00271P0C7V0 271 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 IGFBP4P22692 258 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 STRN3Q13033 797 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 RESP18Q5W5W9 173 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 MYCT1Q8N699 235 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 URGCPQ8TCY9 931 aa22.56■■□□□ 1.2
NOM1-208ENST00000489850 HELQQ8TDG4 1101 aa22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms