RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 POFUT1Q9H488 388 aa4.5□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 ACSS2Q9NR19 701 aa4.5□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa4.5□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 H7C1D1 291 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 NRP1O14786 923 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 FSBPO95073 299 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 HKR1P10072 659 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 TYRP1P17643 537 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 GUCY1B3Q02153 619 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 PRR16Q569H4 304 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 C7orf31Q8N865 590 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 IL17RAQ96F46 866 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 GMLQ99445 158 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 SYBUQ9NX95 663 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.49□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 PTPDC1A2A3K4 754 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 ZNF185O15231 689 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 MTSS1O43312 755 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 PCDH8O95206 1070 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 GAAP10253 952 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 SLC9A1P19634 815 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 NHLH2Q02577 135 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 TP53BP2Q13625 1128 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 ZNF174Q15697 407 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 MAN2A1Q16706 1144 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 SOX7Q9BT81 388 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.48□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 A0A0A6YYJ9 748 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 OPHN1O60890 802 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 NPTXRO95502 500 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 C1RP00736 705 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 CHST14Q8NCH0 376 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 ASB10Q8WXI3 467 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 NELL1Q92832 810 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 PODXL2Q9NZ53 605 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 RNF181Q9P0P0 153 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 TLK1Q9UKI8 766 aa4.47□□□□□ -1.69
SENP6-210ENST00000487548 CYP17A1P05093 508 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 ITGAMP11215 1152 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 ABCG1P45844 678 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 DUSP2Q05923 314 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 CD69Q07108 199 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 RNF169Q8NCN4 708 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 FERMT2Q96AC1 680 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 POGKQ9P215 609 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.46□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 MAFGO15525 162 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 GZMKP49863 264 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 EPHA7Q15375 998 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 NME9Q86XW9 330 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 SYT12Q8IV01 421 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 ZNF384Q8TF68 577 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.45□□□□□ -1.7
SENP6-210ENST00000487548 COQ10AQ96MF6 247 aa4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms