RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487186.5

FAAP20-213, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 3,576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-213ENST00000487186 MPP4Q96JB8 637 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 AGAP3Q96P47 875 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 SFI1A8K8P3 1242 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NCK2O43639 380 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ALADP13716 330 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 TNNC1P63316 161 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 MORC3Q14149 939 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 GRM4Q14833 912 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 MASTLQ96GX5 879 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 MS4A14Q96JA4 679 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 COA1Q9GZY4 146 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 TTLL1O95922 423 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 POTEJP0CG39 1038 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 FBXL16Q8N461 479 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.071e-7■■□□□ 12.2
FAAP20-213ENST00000487186 FBXO41Q8TF61 875 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 PTPRN2Q92932 1015 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 SLC37A4O43826 429 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 RARAP10276 462 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 EPS15P42566 896 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ECE1P42892 770 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 GALK1P51570 392 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 MTMR3Q13615 1198 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 KRT79Q5XKE5 535 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 STMN2Q93045 179 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 BARHL2Q9NY43 387 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 SPAG1Q07617 926 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 DGKZQ13574 1117 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 PSMA7O14818 248 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 PDE5AO76074 875 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NEK2P51955 445 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ARPC4P59998 168 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 SEPT6Q14141 434 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 TAF4BQ92750 862 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 35.3
FAAP20-213ENST00000487186 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 KCNJ18B7U540 433 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ITGA2BP08514 1039 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 KLK7P49862 253 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 KCNJ12Q14500 433 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 PPP2R5BQ15173 497 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 SPATA24Q86W54 205 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 SP8Q8IXZ3 490 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NME8Q8N427 588 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 CASP10Q92851 521 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 DISC1Q9NRI5 854 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 BTBD7Q9P203 1132 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 PNMA3Q9UL41 463 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ASAP2O43150 1006 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 SBK1Q52WX2 424 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 SLC35B4Q969S0 331 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ATRNO75882 1429 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ADRA2BP18089 450 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 VHLP40337 213 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 HERVK_113P62684 666 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 ZNF844Q08AG5 666 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 DLGAP5Q15398 846 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-213ENST00000487186 NPY5RQ15761 445 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms