RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 MAP4K3Q8IVH8 894 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 NLRP4Q96MN2 994 aa28.43■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TGFB1I1O43294 461 aa28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TPM4P67936 248 aa28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 IKZF4Q9H2S9 585 aa28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TMEM134Q9H6X4 195 aa28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TBX21Q9UL17 535 aa28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 LTBP2Q14767 1821 aa28.42■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 RAG1P15918 1043 aa28.41■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 POU5F1BQ06416 359 aa28.41■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.41■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 GBP3Q9H0R5 595 aa28.41■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 C2orf40Q9H1Z8 148 aa28.41■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa28.41■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 B4GALT4O60513 344 aa28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 ZNF18P17022 549 aa28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 GPC3P51654 580 aa28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 PTENP60484 403 aa28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 EDRF1Q3B7T1 1238 aa28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 SYCP3Q8IZU3 236 aa28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 NFKBIZQ9BYH8 718 aa28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 EXOC7Q9UPT5 735 aa28.4■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 CALUO43852 315 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 EFNA5P52803 228 aa28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 CDKAL1Q5VV42 579 aa28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 CCDC113Q9H0I3 377 aa28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 IFT122Q9HBG6 1241 aa28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
SOBP-202ENST00000477448 K7ERI5 159 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 LRRC55Q6ZSA7 311 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 HS2ST1Q7LGA3 356 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 THAP9Q9H5L6 903 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 A0A087WZ62 844 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 PHKA2P46019 1235 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 CDC42EP1Q00587 391 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 STRN3Q13033 797 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 NFIL3Q16649 462 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 ZNF410Q86VK4 478 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 TDHQ8IZJ6 230 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 GOLGA5Q8TBA6 731 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 PPP1R16BQ96T49 567 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa28.38■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 SZT2Q5T011 3432 aa28.37■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 TIMP1P01033 207 aa28.37■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 ATP1A3P13637 1013 aa28.37■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 EPHB4P54760 987 aa28.37■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 SERINC5Q86VE9 423 aa28.37■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 IRF2BP1Q8IU81 584 aa28.37■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 A0A1W2PPC1 479 aa28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 CLIC2O15247 247 aa28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 PTGISQ16647 500 aa28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 NME8Q8N427 588 aa28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 NLRP7Q8WX94 980 aa28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 EEF2KMTQ96G04 330 aa28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 TISP43B9A030 160 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 AP5Z1O43299 807 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 GPR32O75388 356 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 NR3C1P04150 777 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 EDN1P05305 212 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 NR2F2P24468 414 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 CYP2C18P33260 490 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 MBTD1Q05BQ5 628 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 MINDY3Q9H8M7 445 aa28.35■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 PIGRP01833 764 aa28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 PRKCBP05771 671 aa28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 ADAM9Q13443 819 aa28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 SHHQ15465 462 aa28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 MAPK6Q16659 721 aa28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 KIZQ2M2Z5 673 aa28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 SLC39A4Q6P5W5 647 aa28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 C12orf56Q8IXR9 622 aa28.34■■■□□ 2.13
SOBP-202ENST00000477448 CEP63Q96MT8 703 aa28.34■■■□□ 2.13
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