RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 GTF2H3Q13889 308 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 NOMO1Q15155 1222 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF827Q17R98 1081 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 AGBL4Q5VU57 503 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 USP30Q70CQ3 517 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 CLEC14AQ86T13 490 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 GPR156Q8NFN8 814 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 LPPQ93052 612 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 C8orf48Q96LL4 319 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 TOX2Q96NM4 488 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 SCOCQ9UIL1 159 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 INTUQ9ULD6 942 aa6.31□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 RPTORQ8N122 1335 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 C2orf78A6NCI8 922 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM127O75204 238 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 HSPA6P17066 643 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 CTSSP25774 331 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 GJA9P57773 515 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 UBE3CQ15386 1083 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 TTC8Q8TAM2 541 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 SNX33Q8WV41 574 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 DPF2Q92785 391 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 MBD6Q96DN6 1003 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 AIFM3Q96NN9 605 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC154A6NI56 674 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 KIF3BO15066 747 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 B4GALT4O60513 344 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 DTNBO60941 627 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 PHF2O75151 1096 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 OFD1O75665 1012 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ALDH1A2O94788 518 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 POU2F2P09086 479 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP3CAQ08209 521 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 KRT40Q6A162 431 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 HDAC10Q969S8 669 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 AP1G1O43747 822 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 PDCP20941 246 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 WASP42768 502 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 KIR2DL3P43628 341 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 BPIFB4P59827 614 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 BORAQ6PGQ7 559 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 RELTQ969Z4 430 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 TLR9Q9NR96 1032 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ING3Q9NXR8 418 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 NR2E1Q9Y466 385 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-208ENST00000472760 ARHGAP6O43182 974 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 NOBOXO60393 691 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TOX4O94842 621 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ECHS1P30084 290 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 PER3P56645 1201 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 MGAT2Q10469 447 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TBR1Q16650 682 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 LILRA6Q6PI73 481 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 USP45Q70EL2 814 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 MAP3K14Q99558 947 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 JADE2Q9NQC1 790 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 USP40Q9NVE5 1235 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 IPPQ9Y573 584 aa6.27□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ENDOD1O94919 500 aa6.26□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms