RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 FIZ1Q96SL8 496 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 ADAM2Q99965 735 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 OLFML3Q9NRN5 406 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 TBX20Q9UMR3 447 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 MYH11P35749 1972 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
CASQ1-202ENST00000467691 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ENPP3O14638 875 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 BAIAP3O94812 1187 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SMC2O95347 1197 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 KCNJ6P48051 423 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CASP5P51878 434 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 EHHADHQ08426 723 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 DSC3Q14574 896 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 FAM187BQ17R55 369 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 NOTUMQ6P988 496 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HERVK_113Q902F9 699 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SMARCE1Q969G3 411 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 BICD1Q96G01 975 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CHST12Q9NRB3 414 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RGS18Q9NS28 235 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TET1Q8NFU7 2136 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 EFCAB14O75071 495 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R37O75864 691 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 UPP2O95045 317 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MBD3O95983 291 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 AXLP30530 894 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 BMP8BP34820 402 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 DEFB103AP81534 67 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 GTF2BQ00403 316 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 KCNA1Q09470 495 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 STK4Q13043 487 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ISM2Q6H9L7 571 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RNF169Q8NCN4 708 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 STRA6Q9BX79 667 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RMND1Q9NWS8 449 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GUA9 196 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TISP43B9A030 160 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 C9IYK1 514 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 BIN1O00499 593 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 N4BP3O15049 544 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RHOBTB3O94955 611 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 NPTXRO95502 500 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 AMHP03971 560 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SCP2P22307 547 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ABCD1P33897 745 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms