RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 APOL6Q9BWW8 343 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CSRNP2Q9H175 543 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 GRM6O15303 877 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF623O75123 536 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PRKCBP05771 671 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PLA2G4BP0C869 781 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 EFNA5P52803 228 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 KCNK18Q7Z418 384 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 BSNDQ8WZ55 320 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 RSAD1Q9HA92 442 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.63■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ITGB1P05556 798 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 LINC00271P0C7V0 271 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PPM1AP35813 382 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PEX3P56589 373 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 USP28Q96RU2 1077 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 GBP3Q9H0R5 595 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CWH43Q9H720 699 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 RNF19AQ9NV58 838 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 HCSTQ9UBK5 93 aa22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 MYO7AQ13402 2215 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 N4BP3O15049 544 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 B4GALT5O43286 388 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.213e-8■■■■□ 26.2
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SCAF8-204ENST00000461219 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 KRT17Q04695 432 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 GRIN1Q05586 938 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 BECN1Q14457 450 aa22.61■■□□□ 1.21
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SCAF8-204ENST00000461219 PTPAQ15257 358 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 AAK1Q2M2I8 961 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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SCAF8-204ENST00000461219 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.61■■□□□ 1.21
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SCAF8-204ENST00000461219 POF1BQ8WVV4 589 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.61■■□□□ 1.21
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SCAF8-204ENST00000461219 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 IPPQ9Y573 584 aa22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CARNS1A5YM72 827 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 K7ERI5 159 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 FGF18O76093 207 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PLCG1P19174 1290 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 SMTNP53814 917 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 UBXN11Q5T124 520 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 HLA-CQ95604 372 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 COG5Q9UP83 839 aa22.6■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 GUCY2CP25092 1073 aa22.59■■□□□ 1.21
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SCAF8-204ENST00000461219 SLC39A14Q15043 492 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 AMHR2Q16671 573 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 FAM187BQ17R55 369 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 GPBP1Q86WP2 473 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 FZD8Q9H461 694 aa22.59■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 SPG21Q9NZD8 308 aa22.59■■□□□ 1.21
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