RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 CA3P07451 260 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 IDEP14735 1019 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAJB2P25686 324 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SYKP43405 635 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 CASP5P51878 434 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM189BP81408 668 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 POU5F1BQ06416 359 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ECHDC2Q86YB7 292 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM161BQ96MY7 647 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC9A7Q96T83 725 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 FTHL17Q9BXU8 183 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 NFKBIZQ9BYH8 718 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM9Q9C026 710 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 CERS4Q9HA82 394 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 KCND2Q9NZV8 630 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa12.14□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TISP43B9A030 160 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 K7ERI5 159 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TLL1O43897 1013 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ERLIN2O94905 339 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF202O95125 648 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 NPTXRO95502 500 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SLFN14P0C7P3 912 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 MAPTP10636 758 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SARSP49591 514 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNA1Q09470 495 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PPP2R5AQ15172 486 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 MAPK6Q16659 721 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 CLLU1OSQ5K130 101 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC24A5Q71RS6 500 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 HAUS6Q7Z4H7 955 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ENGASEQ8NFI3 743 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 SPIRE2Q8WWL2 714 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TIPINQ9BVW5 301 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 APOL6Q9BWW8 343 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PARVGQ9HBI0 331 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM105AQ9NUU6 356 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PANK4Q9NVE7 773 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ODF2LQ9ULJ1 636 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa12.13□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0U1RQF3 1178 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GUA9 196 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 FRMD3A2A2Y4 597 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 EPOPA6NHQ4 379 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 K7ENM7 598 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 RFXAPO00287 272 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ACKR2O00590 384 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAK2O60296 914 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 EFCAB14O75071 495 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 NR1I2O75469 434 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 DGKIO75912 1065 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 MYBP10242 640 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 NCKAP1LP55160 1127 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ASIC1P78348 528 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 COASYQ13057 564 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM187BQ17R55 369 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 KRBA2Q6ZNG9 492 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBTB33Q86T24 672 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TIFAQ96CG3 184 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 C7orf25Q9BPX7 421 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 HAPLN2Q9GZV7 340 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 C2orf40Q9H1Z8 148 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 TNMDQ9H2S6 317 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf112Q9NSG2 853 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 MTUS1Q9ULD2 1270 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa12.12□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa12.11□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.11□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD63C9JTQ0 380 aa12.11□□□□□ -0.47
RPRD1B-202ENST00000449186 ABLIM1O14639 778 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms