RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIF22Q14807 665 aa27.39■■□□□ 1.98
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PLEKHF1-201ENST00000436066 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.39■■□□□ 1.98
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
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PLEKHF1-201ENST00000436066 ABHD15Q6UXT9 468 aa27.39■■□□□ 1.97
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PLEKHF1-201ENST00000436066 USP38Q8NB14 1042 aa27.36■■□□□ 1.97
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PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa27.36■■□□□ 1.97
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PLEKHF1-201ENST00000436066 HSP90B2PQ58FF3 399 aa27.35■■□□□ 1.97
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PLEKHF1-201ENST00000436066 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.34■■□□□ 1.97
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PLEKHF1-201ENST00000436066 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.34■■□□□ 1.97
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa27.34■■□□□ 1.97
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PLEKHF1-201ENST00000436066 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa27.33■■□□□ 1.97
PLEKHF1-201ENST00000436066 CEP104O60308 925 aa27.33■■□□□ 1.97
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PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT39Q6A163 491 aa27.33■■□□□ 1.97
PLEKHF1-201ENST00000436066 NT5DC3Q86UY8 548 aa27.33■■□□□ 1.97
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFT74Q96LB3 600 aa27.33■■□□□ 1.97
PLEKHF1-201ENST00000436066 THAP2Q9H0W7 228 aa27.33■■□□□ 1.97
PLEKHF1-201ENST00000436066 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PLEKHF1-201ENST00000436066 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.33■■□□□ 1.96
PLEKHF1-201ENST00000436066 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PLEKHF1-201ENST00000436066 RTP1P59025 263 aa27.32■■□□□ 1.96
PLEKHF1-201ENST00000436066 LBX2Q6XYB7 198 aa27.32■■□□□ 1.96
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPM1KQ8N3J5 372 aa27.32■■□□□ 1.96
PLEKHF1-201ENST00000436066 METTL13Q8N6R0 699 aa27.32■■□□□ 1.96
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