RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434481.1

USP9YP3-201, Transcript of USP9Y pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP3, Length 1,766 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP3-201ENST00000434481 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.51□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 A0A088AWK7 358 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 POM121BA6NF01 834 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 FRS3O43559 492 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 SMARCA1P28370 1054 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 LTKP29376 864 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 MALLQ13021 153 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 SPIDRQ14159 915 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 MROH9Q5TGP6 573 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 MYRFLQ96LU7 910 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 DUSP13Q9UII6 198 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 GJD2Q9UKL4 321 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 DEPDC5O75140 1603 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 E9PCH4 1651 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 FGF18O76093 207 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 MAP2K6P52564 334 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TOMM20Q15388 145 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 UVSSAQ2YD98 709 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 CCDC93Q567U6 631 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 WHAMMQ8TF30 809 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 RGMAQ96B86 450 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TET3O43151 1660 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.5□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TSHRP16473 764 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TTC38Q5R3I4 469 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 HDAC10Q969S8 669 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 POLG2Q9UHN1 485 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 USP21Q9UK80 565 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 LAMC1P11047 1609 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TRPM2O94759 1503 aa8.49□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 SLC27A2O14975 620 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 MAFKO60675 156 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 RXRGP48443 463 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 EPHA5P54756 1037 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 GAB4Q2WGN9 574 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 CFAP161Q6P656 301 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 ERP27Q96DN0 273 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 ARMT1Q9H993 441 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 CEP152O94986 1710 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 MBD4O95243 580 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 WASP42768 502 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 IL10RAQ13651 578 aa8.48□□□□□ -1.05
USP9YP3-201ENST00000434481 PMS2P11Q13670 270 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms