RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433843.1

SNHG5-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, human

TSL 2

Gene SNHG5, Length 388 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG5-208	ENST00000433843	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	NME9	Q86XW9	330 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	XYLT1	Q86Y38	959 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	NXPE1	Q8N323	547 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	KCNH6	Q9H252	994 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	SYBU	Q9NX95	663 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	NACAD	O15069	1562 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843		A0A1W2PR48	441 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PRSS38	A1L453	326 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	DNAJC6	O75061	913 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	RFPL3	O75679	317 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ALDH1A2	O94788	518 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PCDH8	O95206	1070 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	APOL3	O95236	402 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ABHD16A	O95870	558 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	NUDT3	O95989	172 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	F2	P00734	622 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PFKM	P08237	780 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	DSG1	Q02413	1049 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	2.73	□□□□□ -1.97	1e-12	■■□□□ 12.9
SNHG5-208	ENST00000433843	ZNF174	Q15697	407 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	VPS72	Q15906	364 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	CFAP100	Q494V2	611 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	METTL24	Q5JXM2	366 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843		Q6YL49	198 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ARL8A	Q96BM9	186 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	UIMC1	Q96RL1	719 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	NDC1	Q9BTX1	674 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	TOR3A	Q9H497	397 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	CABP5	Q9NP86	173 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	TOMM22	Q9NS69	142 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ZMYM3	Q14202	1370 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	WNT10B	O00744	389 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	TRIM24	O15164	1050 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ZNF185	O15231	689 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PPFIA2	O75334	1257 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	FSBP	O95073	299 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	GNAT2	P19087	354 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	FOXI1	Q12951	378 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	LRRC32	Q14392	662 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PTPA	Q15257	358 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	UBE3C	Q15386	1083 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	MAN2A1	Q16706	1144 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	SOGA3	Q5TF21	947 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ANKS6	Q68DC2	871 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	C7orf31	Q8N865	590 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	ABCC9	O60706	1549 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SNHG5-208	ENST00000433843	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	KIAA0355	O15063	1070 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	B3GALT2	O43825	422 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	NCR1	O76036	304 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	RHOBTB3	O94955	611 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	ASMTL	O95671	621 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	LAG3	P18627	525 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	PTH2R	P49190	550 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SNHG5-208	ENST00000433843	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms