RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNAJB1P25685 340 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CA8P35219 290 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NDUFV1P49821 464 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLCB3Q01970 1234 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MBTD1Q05BQ5 628 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HYAL1Q12794 435 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LEXMQ3ZCV2 418 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CPB2Q96IY4 423 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GBP3Q9H0R5 595 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSRNP2Q9H175 543 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TLE6Q9H808 572 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KANSL3Q9P2N6 904 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LZTS1Q9Y250 596 aa17.97■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PP2D1A8MPX8 630 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H3BQ06 376 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SRGAP2BP0DMP2 458 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LIG1P18858 919 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCLP19338 710 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IRS1P35568 1242 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PBX3P40426 434 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NAMPTP43490 491 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRIP1P48552 1158 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCAR1P56945 870 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAMK1Q14012 370 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAPK6Q16659 721 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMC7Q7Z402 723 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM87AQ8NBN3 555 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIFAP3Q92845 792 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRIMPOLQ96LW4 560 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCF25Q9BQ70 676 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 APOL6Q9BWW8 343 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NT5C3AQ9H0P0 336 aa17.96■□□□□ 0.47
CDH23-AS1-201ENST00000428918 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OFD1O75665 1012 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EYA4O95677 639 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDC25AP30304 524 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBXN11Q5T124 520 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLPP4Q5VZY2 271 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC27A1Q6PCB7 646 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC39A11Q8N1S5 342 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RASSF8Q8NHQ8 419 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBC1D13Q9NVG8 400 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IPPQ9Y573 584 aa17.95■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UNC80Q8N2C7 3258 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRANK1O15050 2925 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MEIS3P2A8K0S8 358 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 E9PMD0 336 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ECM1Q16610 540 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AGMOQ6ZNB7 445 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCTD17Q8N5Z5 321 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AK8Q96MA6 479 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADPGKQ9BRR6 497 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa17.94■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC169A6NNP5 214 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 B4GALT5O43286 388 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NR1I2O75469 434 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPTXRO95502 500 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRKCBP05771 671 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBA7P41226 1012 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EFNA5P52803 228 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERVFC1P60507 584 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL17AQ16552 155 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AMHR2Q16671 573 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EFHBQ8N7U6 833 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CALML4Q96GE6 196 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DRC1Q96MC2 740 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.93■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A1B0GUA9 196 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 N4BP3O15049 544 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POMCP01189 267 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALDH2P05091 517 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MLH1P40692 756 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL19A1Q14993 1142 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLUL1Q15846 466 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CTC1Q2NKJ3 1217 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CABP7Q86V35 215 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms