RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	PRKCB	P05771	671 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SPAG1	Q07617	926 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	MAPK6	Q16659	721 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	GPR32	O75388	356 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SERPINC1	P01008	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PIGR	P01833	764 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	EDN1	P05305	212 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	LIG4	P49917	911 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP2J2	P51589	502 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	FANCC	Q00597	558 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ADAM9	Q13443	819 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PTGIS	Q16647	500 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	NME8	Q8N427	588 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	GNA14	O95837	355 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	KRT31	Q15323	416 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	OSMR	Q99650	979 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	FZD8	Q9H461	694 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964		M0QZ92	97 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ARVCF	O00192	962 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ACKR2	O00590	384 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SGPL1	O95470	568 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ADCY5	O95622	1261 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	GART	P22102	1010 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ADSS	P30520	456 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF75D	P51815	510 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PTK7	Q13308	1070 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	WNT8B	Q93098	351 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.48	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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