RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 POLD1P28340 1107 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 GJB7Q6PEY0 223 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 TBX3O15119 743 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 MYBP10242 640 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 GHRP10912 638 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 BIRC3Q13489 604 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 GIT2Q14161 759 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 Q4G0T1 1027 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 RTKN2Q8IZC4 609 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 PSMD1Q99460 953 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 EVI5O60447 810 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 MMEP08473 750 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 CHN1P15882 459 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 STAT2P52630 851 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 KCNH2Q12809 1159 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 MICALL2Q8IY33 904 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 C3orf20Q8ND61 904 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 LRRC45Q96CN5 670 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED1-201ENST00000381218 LINGO3P0C6S8 592 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 NR2F2P24468 414 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 RPA1P27694 616 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF76P36508 570 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 CASP5P51878 434 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 RWDD2BP57060 319 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 KSR1Q8IVT5 923 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SCFD2Q8WU76 684 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 GANQ9H2C0 597 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 GOPCQ9HD26 462 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 RSPH10B2B2RC85 870 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 UBOX5O94941 541 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 RSPH10BP0C881 870 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SREBF1P36956 1147 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 CIAPIN1Q6FI81 312 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SFR1Q86XK3 245 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 LENG9Q96B70 501 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 GMCL1Q96IK5 515 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 FAM20AQ96MK3 541 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 EML1O00423 815 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SHBGP04278 402 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 ABL2P42684 1182 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 REEP2Q9BRK0 252 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 ANKRD33BA6NCL7 494 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 NFIBO00712 420 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 ENTPD3O75355 529 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 FAM151AQ8WW52 585 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-201ENST00000381218 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms