RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 FZD8Q9H461 694 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 POLD4Q9HCU8 107 aa16.97■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SFI1A8K8P3 1242 aa16.96■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF623O75123 536 aa16.96■□□□□ 0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 FIBCD1Q8N539 461 aa16.96■□□□□ 0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 SAMD11Q96NU1 681 aa16.96■□□□□ 0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.96■□□□□ 0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNH3Q9ULD8 1083 aa16.96■□□□□ 0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 AMHR2Q16671 573 aa16.95■□□□□ 0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF169Q8NCN4 708 aa16.95■□□□□ 0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.95■□□□□ 0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087X0B3 334 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GUA9 196 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PQ27 194 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PQ64 194 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PQD8 194 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01553A4QN01 128 aa16.94■□□□□ 0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 N4BP3O15049 544 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC16A4O15374 487 aa16.94■□□□□ 0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 GAP43P17677 238 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF131P52739 623 aa16.94■□□□□ 0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX12PQ92771 950 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ADPGKQ9BRR6 497 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 USP25Q9UHP3 1055 aa16.94■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH11P35749 1972 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 LCHNA4D1U4 455 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 B4GALT5O43286 388 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAK2O60296 914 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK-21P61565 698 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 E2F4Q16254 413 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 DYMQ7RTS9 669 aa16.93■□□□□ 0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CPB2Q96IY4 423 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.93■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRSQ13332 1948 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MYMKA6NI61 221 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 FGFR1P11362 822 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 IDEP14735 1019 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIN2CQ14957 1233 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 UBXN11Q5T124 520 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNN1Q92952 543 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
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