RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377526.3

AUP1-201, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AUP1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-201ENST00000377526 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 HVCN1Q96D96 273 aa21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
AUP1-201ENST00000377526 LTBP2Q14767 1821 aa21.46■■□□□ 1.03
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AUP1-201ENST00000377526 RPS6KA5O75582 802 aa21.45■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 CD52P31358 61 aa21.45■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 TET1Q8NFU7 2136 aa21.45■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 UBE4BO95155 1302 aa21.45■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 STRN3Q13033 797 aa21.44■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.44■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 ACCSQ96QU6 501 aa21.44■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 VWCEQ96DN2 955 aa21.44■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.44■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.43■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 TISP43B9A030 160 aa21.43■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 ERLIN2O94905 339 aa21.43■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.43■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 USP38Q8NB14 1042 aa21.43■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 CPB2Q96IY4 423 aa21.43■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.43■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 PIGRP01833 764 aa21.42■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 CXCL10P02778 98 aa21.42■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.41■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 TMEM206Q9H813 350 aa21.41■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.41■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 ANO10Q9NW15 660 aa21.4■■□□□ 1.02
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AUP1-201ENST00000377526 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 KIF20AO95235 890 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 CSF2RAP15509 400 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 LIG4P49917 911 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 STIM1Q13586 685 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 ZPBP2Q6X784 338 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 GBP3Q9H0R5 595 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.4■■□□□ 1.02
AUP1-201ENST00000377526 ABLIM1O14639 778 aa21.39■■□□□ 1.01
AUP1-201ENST00000377526 MGEA5O60502 916 aa21.39■■□□□ 1.01
AUP1-201ENST00000377526 CCDC192P0DO97 292 aa21.39■■□□□ 1.01
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