RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 BLIDQ8IZY5 108 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.81□□□□□ -1.169e-8■■■■□ 21.2
CTPS1-201ENST00000372616 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CD248Q9HCU0 757 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CEP72Q9P209 647 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.81□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 FOCADQ5VW36 1801 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PRKAB2O43741 272 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 KLRC4O43908 158 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ORC4O43929 436 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MYBP10242 640 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 BTDP43251 543 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC38Q502W7 563 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MIIPQ5JXC2 388 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 DACT2Q5SW24 774 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 NIM1KQ8IY84 436 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 USP38Q8NB14 1042 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TCP11Q8WWU5 503 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 JDP2Q8WYK2 163 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 STAMQ92783 540 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CALML4Q96GE6 196 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 RAB34Q9BZG1 259 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 RAB17Q9H0T7 212 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 EHD4Q9H223 541 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf49Q9H741 205 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 NPHS2Q9NP85 383 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 STK17AQ9UEE5 414 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MYH10P35580 1976 aa7.8□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 GLI1P08151 1106 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 RPS6KA1Q15418 735 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PDXDC1Q6P996 788 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CUL5Q93034 780 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SCLT1Q96NL6 688 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM9Q9C026 710 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SCN9AQ15858 1988 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC53A6NM62 1247 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF263O14978 683 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L7P0C7H9 530 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 HSD17B3P37058 310 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF131P52739 623 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ASIC1P78348 528 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 KCNC4Q03721 635 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 NPY5RQ15761 445 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 SLC18A3Q16572 532 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 RRAGAQ7L523 313 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 CABP7Q86V35 215 aa7.79□□□□□ -1.16
CTPS1-201ENST00000372616 VPS36Q86VN1 386 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms