RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 UGCGQ16739 394 aa25.85■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 UTRNP46939 3433 aa25.85■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 HPDP32754 393 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 TNFAIP1Q13829 316 aa25.84■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC26Q8TAB7 109 aa25.84■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.84■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.84■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.84■■□□□ 1.73
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AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
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AMIGO1-201ENST00000369862 FNTAP49354 379 aa25.84■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 MYL7Q01449 175 aa25.84■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXW10Q5XX13 1052 aa25.84■■□□□ 1.73
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AMIGO1-201ENST00000369862 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.84■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
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AMIGO1-201ENST00000369862 DAAM2Q86T65 1068 aa25.83■■□□□ 1.73
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AMIGO1-201ENST00000369862 LMO3Q8TAP4 145 aa25.83■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 HES6Q96HZ4 224 aa25.83■■□□□ 1.73
AMIGO1-201ENST00000369862 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
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AMIGO1-201ENST00000369862 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.83■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 SYT11Q9BT88 431 aa25.83■■□□□ 1.72
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AMIGO1-201ENST00000369862 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa25.83■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 PARP14Q460N5 1801 aa25.82■■□□□ 1.72
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AMIGO1-201ENST00000369862 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.82■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP89Q96ST8 783 aa25.82■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.82■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 AMACRQ9UHK6 382 aa25.82■■□□□ 1.72
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AMIGO1-201ENST00000369862 BAG6P46379 1132 aa25.8■■□□□ 1.72
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AMIGO1-201ENST00000369862 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.8■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 ACCSQ96QU6 501 aa25.8■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM206Q9H813 350 aa25.8■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.8■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 TGFB2P61812 414 aa25.8■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 ALCAMQ13740 583 aa25.8■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 GINM1Q9NU53 330 aa25.8■■□□□ 1.72
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AMIGO1-201ENST00000369862 EMSYQ7Z589 1322 aa25.8■■□□□ 1.72
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AMIGO1-201ENST00000369862 LRRN2O75325 713 aa25.79■■□□□ 1.72
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AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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AMIGO1-201ENST00000369862 MICALL2Q8IY33 904 aa25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 C4orf19Q8IY42 314 aa25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 ATG4CQ96DT6 458 aa25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 CYFIP2Q96F07 1278 aa25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 NCANO14594 1321 aa25.79■■□□□ 1.72
AMIGO1-201ENST00000369862 GMNCA6NCL1 334 aa25.79■■□□□ 1.72
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