RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 PLXNC1O60486 1568 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 TIAM1Q13009 1591 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 XDHP47989 1333 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 UBE2QL1A1L167 161 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-204ENST00000367379 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-204ENST00000367379 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-204ENST00000367379 ACSS2Q9NR19 701 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-204ENST00000367379 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRC-204ENST00000367379 C16orf92Q96LL3 132 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 TCF25Q9BQ70 676 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 TTPALQ9BTX7 342 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 GPR87Q9BY21 358 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-204ENST00000367379 PLA2R1Q13018 1463 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRC-204ENST00000367379 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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PTPRC-204ENST00000367379 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRC-204ENST00000367379 PLD2O14939 933 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 TOX4O94842 621 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRC-204ENST00000367379 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRC-204ENST00000367379 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 B4E1Z4 1266 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 E9PSI1 815 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 RPS6KA4O75676 772 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 CYP17A1P05093 508 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRC-204ENST00000367379 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRC-204ENST00000367379 HAS1Q92839 578 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 MNTQ99583 582 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRC-204ENST00000367379 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 PZPP20742 1482 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-204ENST00000367379 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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PTPRC-204ENST00000367379 MYBPC3Q14896 1274 aa6.93□□□□□ -1.3
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