RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 TEX101Q9BY14 249 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 RNF7Q9UBF6 113 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 GAGE12BA1L429 117 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 BMPR1AP36894 532 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 BCAR1P56945 870 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 FAM83AQ86UY5 434 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0A6YYJ9 748 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 UNC119BA6NIH7 251 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 NPTXRO95502 500 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 GAAP10253 952 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 DOK3Q7L591 496 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 UIMC1Q96RL1 719 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM2Q99965 735 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 NRP1O14786 923 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 CASRP41180 1078 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 SYT12Q8IV01 421 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 ASB10Q8WXI3 467 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 ACSS2Q9NR19 701 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-202ENST00000367364 MATN4O95460 622 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 GUCY1B3Q02153 619 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 TP53BP2Q13625 1128 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 EPC1Q9H2F5 836 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 MTG2Q9H4K7 406 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 ALDH1A2O94788 518 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 ESRRBO95718 433 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV2-14P01704 120 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 MPLP40238 635 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 NHLH1Q02575 133 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 XYLT1Q86Y38 959 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 IL17RAQ96F46 866 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 OPHN1O60890 802 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 FSBPO95073 299 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 WNT3AP56704 352 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 EPHA7Q15375 998 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 MAN2A1Q16706 1144 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 TLK1Q9UKI8 766 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 C1QL1O75973 258 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 APPP05067 770 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 CTGFP29279 349 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 NHLH2Q02577 135 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 ADCY2Q08462 1091 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 MARCH11A6NNE9 402 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 KCNQ2O43526 872 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 SPDEFO95238 335 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 CYP17A1P05093 508 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 M0R2C6 588 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 BLOC1S1P78537 153 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 MPP3Q13368 585 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 NME9Q86XW9 330 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.28□□□□□ -1.4
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