RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC41Q15345 812 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 UAP1L1Q3KQV9 507 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT40Q6A162 431 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 FMNL3Q8IVF7 1028 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHPFQ8IZ52 775 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF480Q8WV37 535 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 JADE2Q9NQC1 790 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHPF2Q9P2E5 772 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCOCQ9UIL1 159 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNM3Q9UQ16 869 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPTORQ8N122 1335 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2orf78A6NCI8 922 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM171A2A8MVW0 826 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRP1O14786 923 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTSS1O43312 755 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKR1B10O60218 316 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARCH6O60337 910 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 B4GALT4O60513 344 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHF2O75151 1096 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFPL1O75677 317 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 JUNP05412 331 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSIG10L2P0DP72 767 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMP7P18075 431 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTSSP25774 331 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ECHS1P30084 290 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAC3P60763 192 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 HGFACQ04756 655 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGAT2Q10469 447 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFYCQ13952 458 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOMO1Q15155 1222 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE3CQ15386 1083 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBR1Q16650 682 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF151Q2KHN1 245 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 MST1LQ2TV78 715 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE13Q4V321 117 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIGA2Q7L4E1 593 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD53Q8N9V6 530 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR156Q8NFN8 814 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 FEZF2Q8TBJ5 459 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX33Q8WV41 574 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRG4Q8WWG1 115 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLR9Q9NR96 1032 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAMTOR5O43504 91 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC26A4O43511 780 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENDOD1O94919 500 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 GYPEP15421 78 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP2C19P33261 490 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNR2P34972 360 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIR2DL3P43628 341 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADCY7P51828 1080 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP2Q05923 314 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP3CAQ08209 521 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 SURF1Q15526 300 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NXNQ6DKJ4 435 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD15Q6UXT9 468 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIAH1Q8IUQ4 282 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPH2Q8IWU9 490 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 HDAC10Q969S8 669 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNC2Q96PR1 638 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMF1Q96S06 567 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 C7orf25Q9BPX7 421 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSL2Q9HCI7 577 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NMRK2Q9NPI5 230 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 ING3Q9NXR8 418 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCDNQ9UBB6 729 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 RCAN3Q9UKA8 241 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-78P-201ENST00000362897 INTUQ9ULD6 942 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms