RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 IGFLR1Q9H665 355 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 H3BQV1 296 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LAD1O00515 517 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01565O15544 149 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN1O60635 241 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF623O75123 536 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TBX10O75333 385 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GLRA2P23416 452 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ARL2P36404 184 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LTBRP36941 435 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NRIP1P48552 1158 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 POU5F1BQ06416 359 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NOTUMQ6P988 496 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PGBD4Q96DM1 585 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 FAM122AQ96E09 287 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC51Q96ER9 411 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 RAB34Q9BZG1 259 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SPG21Q9NZD8 308 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 FAM50BQ9Y247 325 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LZTS1Q9Y250 596 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.5□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 FSD2A1L4K1 749 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 IL9P15248 144 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MUTP22033 750 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 AXLP30530 894 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G5P39877 138 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PRPHP41219 470 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFV1P49821 464 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 BCAR1P56945 870 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ERVFC1P60507 584 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PLCB3Q01970 1234 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 KRT17Q04695 432 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CUL4AQ13619 759 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 BECN1Q14457 450 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CLUL1Q15846 466 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 AMHR2Q16671 573 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 UBXN11Q5T124 520 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PADI6Q6TGC4 694 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 EFHBQ8N7U6 833 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 URGCPQ8TCY9 931 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM169Q96HH4 297 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CPB2Q96IY4 423 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TCF25Q9BQ70 676 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GBP3Q9H0R5 595 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TLE6Q9H808 572 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 RSAD1Q9HA92 442 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TRIP11Q15643 1979 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CARNS1A5YM72 827 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PP2D1A8MPX8 630 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 FSCN2O14926 492 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 B4GALT5O43286 388 aa8.48□□□□□ -1.05
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