RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 RAD54LQ92698 747 aa29.82■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 GRM6O15303 877 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 HOXA2O43364 376 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 AXLP30530 894 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 NPTX2P47972 431 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PPP2R5AQ15172 486 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 NOTUMQ6P988 496 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 AGMOQ6ZNB7 445 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 ABI1Q8IZP0 508 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 IFT74Q96LB3 600 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 C2orf40Q9H1Z8 148 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 RWDD3Q9Y3V2 267 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 HES2Q9Y543 173 aa29.81■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 A0A087X0B3 334 aa29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 CSPG5O95196 566 aa29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PRKCBP05771 671 aa29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PBX3P40426 434 aa29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
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TPGS1-201ENST00000359315 GPBP1Q86WP2 473 aa29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL23Q8NBE8 558 aa29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 RNF39Q9H2S5 420 aa29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 IPPQ9Y573 584 aa29.8■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 SPTLC2O15270 562 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 BRD1O95696 1058 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 RB1P06400 928 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 SKIP12755 728 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 FAM187BQ17R55 369 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC43Q8N309 656 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 DRC1Q96MC2 740 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa29.79■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC169A6NNP5 214 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 OFD1O75665 1012 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 NPTXRO95502 500 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 YEATS4O95619 227 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 ITGB1P05556 798 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB1P25685 340 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 MAPK6Q16659 721 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 NAALADL2Q58DX5 795 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 TAS1R3Q7RTX0 852 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC51Q96ER9 411 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 REEP2Q9BRK0 252 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PLVAPQ9BX97 442 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PDZD7Q9H5P4 517 aa29.78■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1B0GUA9 196 aa29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 NCLP19338 710 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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TPGS1-201ENST00000359315 EEF1DP3Q658K8 133 aa29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PRIMPOLQ96LW4 560 aa29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 APOL6Q9BWW8 343 aa29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 PLAGL2Q9UPG8 496 aa29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 MYO9BQ13459 2157 aa29.77■■■□□ 2.36
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1671Q9BY89 1806 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 SLC16A4O15374 487 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 B4GALT3O60512 393 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PPP6R2O75170 966 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 CAMK1Q14012 370 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 NT5DC1Q5TFE4 455 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PGBD4Q96DM1 585 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 TIPINQ9BVW5 301 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 KMT5AQ9NQR1 393 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 NLRC5Q86WI3 1866 aa29.76■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ACKR2O00590 384 aa29.75■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PLS3P13797 630 aa29.75■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa29.75■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 NOMO2Q5JPE7 1267 aa29.75■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 SLC27A1Q6PCB7 646 aa29.75■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 GLB1LQ6UWU2 654 aa29.75■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 P2RX5Q93086 422 aa29.75■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PANK2Q9BZ23 570 aa29.75■■■□□ 2.35
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TPGS1-201ENST00000359315 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa29.74■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ITGA4P13612 1032 aa29.74■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 LAG3P18627 525 aa29.74■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 EFNA5P52803 228 aa29.74■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 BECN1Q14457 450 aa29.74■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 SPPL3Q8TCT6 385 aa29.74■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC39Q9UFE4 941 aa29.74■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 MYH15Q9Y2K3 1946 aa29.74■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
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