RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 AMPD3Q01432 767 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 MAPK7Q13164 816 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 KARSQ15046 597 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ARSHQ5FYA8 562 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ADALQ6DHV7 355 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC27A1Q6PCB7 646 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 SV2BQ7L1I2 683 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ABI1Q8IZP0 508 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 IQUBQ8NA54 791 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 RUSC1Q9BVN2 902 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 TNMDQ9H2S6 317 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PARVGQ9HBI0 331 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 USP25Q9UHP3 1055 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A087WWV3 80 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 LCHNA4D1U4 455 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 K7ERI5 159 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 BMPR1AP36894 532 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ME1P48163 572 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 UBE3AQ05086 875 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 GRIN2CQ14957 1233 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 GLB1LQ6UWU2 654 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM192Q8IY95 271 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 LRRC43Q8N309 656 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 CLIC6Q96NY7 704 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 ADPGKQ9BRR6 497 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 KMT5AQ9NQR1 393 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM13BQ9NYF5 915 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 GIT1Q9Y2X7 761 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-203ENST00000345015 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 H3BNC9 293 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PRKCBP05771 671 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MYL1P05976 194 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 LINC00271P0C7V0 271 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 GAP43P17677 238 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CMA1P23946 247 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PPM1AP35813 382 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 STAT6P42226 847 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 NCKAP1LP55160 1127 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PEX3P56589 373 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PTPROQ16827 1216 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 EPC2Q52LR7 807 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 RESP18Q5W5W9 173 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ZPBP2Q6X784 338 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 USP49Q70CQ1 688 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MAEAQ7L5Y9 396 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 GPBP1Q86WP2 473 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 BSNDQ8WZ55 320 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 HVCN1Q96D96 273 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CASD1Q96PB1 797 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 KBTBD4Q9NVX7 518 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PCDHA7Q9UN72 937 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TNFSF13BQ9Y275 285 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 EYSQ5T1H1 3165 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MYH11P35749 1972 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1W2PQ27 194 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1W2PQ64 194 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A1W2PQD8 194 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TBCAO75347 108 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 LAG3P18627 525 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FGFR4P22455 802 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ALCAMQ13740 583 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 GIT2Q14161 759 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MCM6Q14566 821 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 E2F4Q16254 413 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 KYAT1Q16773 422 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 UBXN11Q5T124 520 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 SPATA32Q96LK8 384 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 REEP2Q9BRK0 252 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 OLFML3Q9NRN5 406 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF19AQ9NV58 838 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 LZTS1Q9Y250 596 aa13.44□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms