RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 A0A1W2PQY0 241 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 KIF20AO95235 890 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 HOXC8P31273 242 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ARID5BQ14865 1188 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PPP2R5AQ15172 486 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ZBTB33Q86T24 672 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.21■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ITGA7Q13683 1181 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 CBWD2Q8IUF1 395 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 MAP7D2Q96T17 732 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 UBE4BO95155 1302 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ZEB2O60315 1214 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 GPR32O75388 356 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PRKCBP05771 671 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TMOD1P28289 359 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 WNT7BP56706 349 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PTENP60484 403 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 DLG4P78352 724 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 APBA1Q02410 837 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TMEM206Q9H813 350 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PPME1Q9Y570 386 aa15.2■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 A0A1B0GTH6 734 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 N4BP3O15049 544 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 CETN3O15182 167 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 EXOC3O60645 756 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ADRB2P07550 413 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TRIM49P0CI25 452 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TRIM49CP0CI26 452 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 LIG4P49917 911 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 STRN3Q13033 797 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 DRC7Q8IY82 874 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 POMGNT1Q8WZA1 660 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ADAMTS10Q9H324 1103 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ACOT2P49753 483 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 CEP120Q8N960 986 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 DMAC2Q9NW81 257 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 NR1I3Q14994 352 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TMC6Q7Z403 805 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TMEM130Q8N3G9 435 aa15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 OSTNP61366 133 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ALCAMQ13740 583 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PTGISQ16647 500 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 MAPK6Q16659 721 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 AMHR2Q16671 573 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 GPIHBP1Q8IV16 184 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ELMO3Q96BJ8 720 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 FAM213AQ9BRX8 229 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 KPNA6O60684 536 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TNFSF9P41273 254 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.18■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 LRRN2O75325 713 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 UBXN1Q04323 297 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TFDP1Q14186 410 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TCERG1LQ5VWI1 586 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TMEM192Q8IY95 271 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 FAM186BQ8IYM0 893 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 BORCS6Q96GS4 357 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 ZNF333Q96JL9 665 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 CEP63Q96MT8 703 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 LRRC10BA6NIK2 292 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 B4GALT4O60513 344 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 PHKA2P46019 1235 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.17■□□□□ 0.02
PMS1-201ENST00000342075 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms