RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 SIX2Q9NPC8 291 aa22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3-201ENST00000329553 H0YCG3 227 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TLR2O60603 784 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 NAMPTP43490 491 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLA2G4AP47712 749 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 RABGGTAQ92696 567 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC42Q96M95 316 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAPK13O15264 365 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARHGAP25P42331 645 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 VAMP7P51809 220 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM193AP78312 1265 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 HGSNATQ68CP4 663 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SAAL1Q96ER3 474 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 EPC1Q9H2F5 836 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ST7Q9NRC1 585 aa22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 GH1P01241 217 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 DEPTORQ8TB45 409 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TINF2Q9BSI4 451 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 USP20Q9Y2K6 914 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPME1Q9Y570 386 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 PASKQ96RG2 1323 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 KIF5CO60282 957 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ADRB2P07550 413 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC26A2P50443 739 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 GOLGA1Q92805 767 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 KCNN1Q92952 543 aa22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ABCD1P33897 745 aa22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 KRT83P78385 493 aa22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TEX35Q5T0J7 233 aa22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 BICD1Q96G01 975 aa22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF263O14978 683 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC10A3P09131 477 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 CYP27A1Q02318 531 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPP3CAQ08209 521 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 CAPSQ13938 189 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 GJB7Q6PEY0 223 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 IFNL1Q8IU54 200 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 AFG1LQ8WV93 481 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TFR2Q9UP52 801 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 K7ERI5 159 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 MYL7Q01449 175 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 FBXL18Q96ME1 805 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRPC6Q9Y210 931 aa22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 HBP1O60381 514 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 GARTP22102 1010 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 KIF11P52732 1056 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 STRN3Q13033 797 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ACVR2BQ13705 512 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TUBB2AQ13885 445 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 MORN1Q5T089 497 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 IER5Q5VY09 327 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPTC7Q8NI37 304 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 TBC1D8O95759 1140 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SERPING1P05155 500 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 LGALS2P05162 132 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SMPD1P17405 629 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARID5AQ03989 594 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 C17orf99Q6UX52 265 aa22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3-201ENST00000329553 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms