RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321556.4

PINK1-201, Transcript of PTEN induced putative kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PINK1, Length 2,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1-201ENST00000321556 KIF22Q14807 665 aa25.52■■□□□ 1.68
PINK1-201ENST00000321556 PPP2R5AQ15172 486 aa25.52■■□□□ 1.68
PINK1-201ENST00000321556 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.52■■□□□ 1.68
PINK1-201ENST00000321556 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.52■■□□□ 1.68
PINK1-201ENST00000321556 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.52■■□□□ 1.68
PINK1-201ENST00000321556 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.52■■□□□ 1.68
PINK1-201ENST00000321556 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PINK1-201ENST00000321556 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.52■■□□□ 1.68
PINK1-201ENST00000321556 GMNCA6NCL1 334 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 RAD17O75943 681 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 NSMFQ6X4W1 530 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CARD9Q9H257 536 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 NFIBO00712 420 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CLSTN1O94985 981 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 MTMR3Q13615 1198 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 NFIL3Q16649 462 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 DUPD1Q68J44 220 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 TTC27Q6P3X3 843 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CPXCR1Q8N123 301 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 EFCC1Q9HA90 598 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa25.51■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 H0YIN7 160 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 COMTP21964 271 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 KCNJ1P48048 391 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SLC16A4O15374 487 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CYP26A1O43174 497 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ICE2Q659A1 982 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 STRA6Q9BX79 667 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SPP2Q13103 211 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PRELID2Q8N945 189 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SAAL1Q96ER3 474 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PPIP5K2O43314 1243 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 BCRP11274 1271 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SLCO1A2P46721 670 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 FNTAP49354 379 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 BIRC3Q13489 604 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 RAB17Q9H0T7 212 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 TRAPPC3O43617 180 aa25.49■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PPFIA2O75334 1257 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 MMEP08473 750 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CCDC172P0C7W6 258 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PYGMP11217 842 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CHRNB2P17787 502 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 RPL21P46778 160 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PEX3P56589 373 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 UGCGQ16739 394 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PSMD1Q99460 953 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ADRB2P07550 413 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.48■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 FGFR4P22455 802 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PMS2P54278 862 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SOX10P56693 466 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SLC29A2Q14542 456 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SEMA4DQ92854 862 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 C21orf2O43822 256 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 AGBL2Q5U5Z8 902 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 SELENOSQ9BQE4 189 aa25.47■■□□□ 1.67
PINK1-201ENST00000321556 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.7 ms