RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320393.8

BCKDHB-201, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHB, Length 3,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHB-201ENST00000320393 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 GNPTABQ3T906 1256 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 MREGQ8N565 214 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 AGPAT1Q99943 283 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 POLLQ9UGP5 575 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CLRN2A0PK11 232 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PDE6CP51160 858 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 SETDB1Q15047 1291 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 H0YGN5 161 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PDXKO00764 312 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 TRIM7Q9C029 511 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 NFS1Q9Y697 457 aa14.88□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 RASA4BC9J798 803 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 RASA4O43374 803 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 LGR5O75473 907 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ATF2P15336 505 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 SLC12A3P55017 1021 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CD302Q8IX05 232 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 RUBCNQ92622 972 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 SLC16A4O15374 487 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 GJB6O95452 261 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 TNFRSF8P28908 595 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 MAPK4P31152 587 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PEX3P56589 373 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ADCY2Q08462 1091 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 FAM228AQ86W67 206 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 TRPC6Q9Y210 931 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 HIP1RO75146 1068 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CD58P19256 250 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ERICH1Q86X53 443 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 SPOCK2Q92563 424 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 IFT74Q96LB3 600 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.87□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ASTN1O14525 1302 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 MXI1P50539 228 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 RHBDL3P58872 404 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 GPC5P78333 572 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 TTC27Q6P3X3 843 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PRELID2Q8N945 189 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CCT6BQ92526 530 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ERP27Q96DN0 273 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 STK33Q9BYT3 514 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 EDIL3O43854 480 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CHKAP35790 457 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PTENP60484 403 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF394Q53GI3 561 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ABCB11O95342 1321 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CHD4Q14839 1912 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 SOX10P56693 466 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 OVGP1Q12889 678 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 TEKT1Q969V4 418 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 MIEF2Q96C03 454 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 HAO1Q9UJM8 370 aa14.86□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 DISP2A7MBM2 1401 aa14.85□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.85□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 SERPINB2P05120 415 aa14.85□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 KRT16P08779 473 aa14.85□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 RARAP10276 462 aa14.85□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 CA4P22748 312 aa14.85□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 HOXD13P35453 343 aa14.85□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 HHATQ5VTY9 493 aa14.85□□□□□ -0.03
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms