RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 CBWD6Q4V339 395 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CEP57Q86XR8 500 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 TPH2Q8IWU9 490 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 COG5Q9UP83 839 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 EML1O00423 815 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 BACH1O14867 736 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SERPINB2P05120 415 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ICA1Q05084 483 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CALCOCO2Q13137 446 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 USH1GQ495M9 461 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PRELID2Q8N945 189 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 C18orf8Q96DM3 657 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 VEZTQ9HBM0 779 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RGL1Q9NZL6 768 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SIPA1L1O43166 1804 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SFI1A8K8P3 1242 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RIPK2O43353 540 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 GZMAP12544 262 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PRELPP51888 382 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PPP1R7Q15435 360 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ODR4Q5SWX8 454 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ART4Q93070 314 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.9□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 A0A1B0GUA9 196 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 F5H6K3 240 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SLITRK3O94933 977 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TRIM49P0CI25 452 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TRIM49CP0CI26 452 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 DYDC2Q96IM9 177 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 AFF2P51816 1311 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ATP6V1G2O95670 118 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 COPB2P35606 906 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PPARDQ03181 441 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CERS5Q8N5B7 392 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SLC5A5Q92911 643 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 TMEM206Q9H813 350 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CEP83Q9Y592 693 aa14.89□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SMIM23A6NLE4 172 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 RIMBP2O15034 1052 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 GAS7O60861 476 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PSMD10O75832 226 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 ECEL1O95672 775 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 BMP3P12645 472 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 MAN1A1P33908 653 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PEX5P50542 639 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SCNN1DP51172 638 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 CNGA2Q16280 664 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MKS1-201ENST00000313863 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms