RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
TMX3-201ENST00000299608 TMTC4Q5T4D3 741 aa11.4□□□□□ -0.58
TMX3-201ENST00000299608 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TMX3-201ENST00000299608 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TMX3-201ENST00000299608 ARHGAP24Q8N264 748 aa11.4□□□□□ -0.58
TMX3-201ENST00000299608 CFAP36Q96G28 342 aa11.4□□□□□ -0.58
TMX3-201ENST00000299608 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.4□□□□□ -0.58
TMX3-201ENST00000299608 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.4□□□□□ -0.58
TMX3-201ENST00000299608 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.4□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.4□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.4□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.4□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 PDXKO00764 312 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TRAPPC3O43617 180 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TJP3O95049 919 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 SLC12A1Q13621 1099 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ACCSLQ4AC99 568 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 DONSONQ9NYP3 566 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 RNF14Q9UBS8 474 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 CPA4Q9UI42 421 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 DIP2BQ9P265 1576 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 MYMKA6NI61 221 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TBX3O15119 743 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 PDGFRBP09619 1106 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ASPHQ12797 758 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 STK4Q13043 487 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 GINM1Q9NU53 330 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TTC30BQ8N4P2 665 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 FAF2Q96CS3 445 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 NCAPGQ9BPX3 1015 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 CYP26A1O43174 497 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 MT-ND3P03897 115 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 LCP1P13796 627 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 IRX4P78413 519 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 DGKDQ16760 1214 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 GPATCH11Q8N954 259 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TNIP3Q96KP6 325 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 RIT2Q99578 217 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 KIF2CQ99661 725 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 NUP85Q9BW27 656 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.39□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 MYBP10242 640 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 SOX5P35711 763 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 FCGRTP55899 365 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 RGL2O15211 777 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 SRGAP2O75044 1071 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 NNMTP40261 264 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 JADE1Q6IE81 842 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 RRAGCQ9HB90 399 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 SNX24Q9Y343 169 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ACSL3O95573 720 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 ICAM1P05362 532 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 MAFGO15525 162 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 HBP1O60381 514 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 GRIK1P39086 918 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 RGS7P49802 495 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 EPHB4P54760 987 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 DDR1Q08345 913 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 FMO2Q99518 471 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 NUF2Q9BZD4 464 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMX3-201ENST00000299608 PLS3P13797 630 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms