RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 PRO3102Q9H379 93 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CHST12Q9NRB3 414 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 DENND3A2RUS2 1198 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 K7ERI5 159 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 MBD3O95983 291 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PNOCQ13519 176 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ALCAMQ13740 583 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 KCNB1Q14721 858 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 RASIP1Q5U651 963 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA20Q8TB22 786 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 GPT2Q8TD30 523 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 HVCN1Q96D96 273 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 MGEA5O60502 916 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 RHOBTB3O94955 611 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 EDN1P05305 212 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PSMD2Q13200 908 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC51Q96ER9 411 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 RGS18Q9NS28 235 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 EXOC1Q9NV70 894 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GUA9 196 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 B4GALT5O43286 388 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PIGRP01833 764 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 STRN3Q13033 797 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 NOTUMQ6P988 496 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 HPS3Q969F9 1004 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 GSDMAQ96QA5 445 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ADAM2Q99965 735 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TBX20Q9UMR3 447 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 GBF1Q92538 1859 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 UBE4BO95155 1302 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 C9IYK1 514 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ENPP3O14638 875 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 SMC2O95347 1197 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 GCNT3O95395 438 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PTMSP20962 102 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CASP5P51878 434 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 SHHQ15465 462 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ZPBP2Q6X784 338 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 RMND1Q9NWS8 449 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CITO14578 2027 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0U1RQF3 1178 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 MYBP10242 640 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PROZP22891 400 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 RAB27AP51159 221 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 FAM189BP81408 668 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 STK4Q13043 487 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 UBXN11Q5T124 520 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 SMARCE1Q969G3 411 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 CPB2Q96IY4 423 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 SLC9A7Q96T83 725 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms