RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 OSTNP61366 133 aa11.97□□□□□ -0.49
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GGPS1-201ENST00000282841 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.97□□□□□ -0.49
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GGPS1-201ENST00000282841 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.96□□□□□ -0.5
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GGPS1-201ENST00000282841 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
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GGPS1-201ENST00000282841 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GGPS1-201ENST00000282841 SPAG5Q96R06 1193 aa11.95□□□□□ -0.5
GGPS1-201ENST00000282841 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.95□□□□□ -0.5
GGPS1-201ENST00000282841 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GGPS1-201ENST00000282841 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.95□□□□□ -0.5
GGPS1-201ENST00000282841 TRPM7Q96QT4 1865 aa11.95□□□□□ -0.5
GGPS1-201ENST00000282841 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.94□□□□□ -0.5
GGPS1-201ENST00000282841 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.94□□□□□ -0.5
GGPS1-201ENST00000282841 H3BRB1 525 aa11.94□□□□□ -0.5
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