RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 RDM1Q8NG50 284 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SLC5A5Q92911 643 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 TRIM49CP0CI26 452 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GCLMP48507 274 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 SLC35C1Q96A29 364 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TCHPQ9BT92 498 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CFAP57Q96MR6 1250 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 SURF1Q15526 300 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 JAMLQ86YT9 394 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 SNF8Q96H20 258 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CEP170P1Q96L14 293 aa9.49□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.49□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 SLC15A2Q16348 729 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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