RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ADCY2Q08462 1091 aa16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 LMO3Q8TAP4 145 aa16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 DYDC2Q96IM9 177 aa16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.1■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 SIPA1L1O43166 1804 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 PODXLO00592 558 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 SERPINB2P05120 415 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 HSPA6P17066 643 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 FGFR4P22455 802 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 MSL1Q68DK7 614 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TUFT1Q9NNX1 390 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 FTLP02792 175 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CYP3A4P08684 503 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ALAS1P13196 640 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 BFSP1Q12934 665 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 UBE4BO95155 1302 aa16.09■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 F5H6K3 240 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 RIPK2O43353 540 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 CHMP2AO43633 222 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 GSTA1P08263 222 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 RXRBP28702 533 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 SLCO1A2P46721 670 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 PEX5P50542 639 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ZNF131P52739 623 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 FBXO41Q8TF61 875 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 WDR18Q9BV38 432 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 PARP2Q9UGN5 583 aa16.08■□□□□ 0.17
SYP-201ENST00000263233 ATP6V1G2O95670 118 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 COMTP21964 271 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GBP1P32455 592 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ELF1P32519 619 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 NF2P35240 595 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TCEAL1Q15170 157 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 E2F5Q15329 346 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PPP1R7Q15435 360 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RDH13Q8NBN7 331 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 HOOK2Q96ED9 719 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PFASO15067 1338 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 LY75O60449 1722 aa16.08■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CACNB3P54284 484 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ICA1Q05084 483 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TCP10Q12799 353 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CROCCP2Q86T23 111 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 BANK1Q8NDB2 785 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TEKT1Q969V4 418 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 BCS1LQ9Y276 419 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 EXOC3O60645 756 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PSMD10O75832 226 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GGPS1O95749 300 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PYGMP11217 842 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RARGP13631 454 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RFX1P22670 979 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 IFNAR2P48551 515 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GPC5P78333 572 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 DLG4P78352 724 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CNGA2Q16280 664 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ART4Q93070 314 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms