RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 CPB2Q96IY4 423 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 YME1L1Q96TA2 773 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 DACT1Q9NYF0 836 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 INSL6Q9Y581 213 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.23■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 EPOPA6NHQ4 379 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 MYMKA6NI61 221 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 CCDC169A6NNP5 214 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 DGKIO75912 1065 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 STAG3L1P0CL83 205 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 PLS3P13797 630 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.319e-6■□□□□ 9.7
COX5B-201ENST00000258424 UBXN11Q5T124 520 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 DHX58Q96C10 678 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 FZD8Q9H461 694 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 RNF19AQ9NV58 838 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 USP20Q9Y2K6 914 aa23.22■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 A0A0U1RQF3 1178 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 LINC01553A4QN01 128 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 LIG1P18858 919 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 FAM187BQ17R55 369 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ADALQ6DHV7 355 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 SV2BQ7L1I2 683 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 MYO9BQ13459 2157 aa23.21■■□□□ 1.31
COX5B-201ENST00000258424 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 SLC16A4O15374 487 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 PRKCBP05771 671 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 FGFR1P11362 822 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 AXLP30530 894 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 ZNF131P52739 623 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 DYMQ7RTS9 669 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 STAMQ92783 540 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.2■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 VCANP13611 3396 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 FAM13AO94988 1023 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 CMA1P23946 247 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 EFNA5P52803 228 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 MAPK6Q16659 721 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 NOTUMQ6P988 496 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 RNF169Q8NCN4 708 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 DDX12PQ92771 950 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.19■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 A0A1B0GVL5 298 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 TNFRSF10AO00220 468 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 ACKR2O00590 384 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 PFKFB1P16118 471 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 IQUBQ8NA54 791 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 LPPQ93052 612 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 CUEDC2Q9H467 287 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 HPSEQ9Y251 543 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.18■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 A0A1B0GUA9 196 aa23.17■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 LINC00271P0C7V0 271 aa23.17■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 RAB27AP51159 221 aa23.17■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 NCKAP1LP55160 1127 aa23.17■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 LONRF3Q496Y0 759 aa23.17■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.17■■□□□ 1.3
COX5B-201ENST00000258424 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.17■■□□□ 1.3
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