RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 PTENP60484 403 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 POU5F1BQ06416 359 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 IKBKEQ14164 716 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 DEPTORQ8TB45 409 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 GDAQ9Y2T3 454 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SLC16A4O15374 487 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC192P0DO97 292 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 FGFR4P22455 802 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP12P59046 1061 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SHHQ15465 462 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 KCNN1Q92952 543 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 K7ENM7 598 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 EFCAB14O75071 495 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R37O75864 691 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 BAIAP3O94812 1187 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 MRE11P49959 708 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 CASP5P51878 434 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 HERVK_113Q902F9 699 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 STRA6Q9BX79 667 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 H0YCG3 227 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 TYRO3Q06418 890 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 TCTN1Q2MV58 587 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 TDHQ8IZJ6 230 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ERLIN2O94905 339 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 GCNT3O95395 438 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 MYBP10242 640 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 SCP2P22307 547 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 KCNJ6P48051 423 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 GTF2BQ00403 316 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ALCAMQ13740 583 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 STX1AQ16623 288 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 PRO3102Q9H379 93 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD11-201ENST00000249504 ABCD1P33897 745 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 HVCN1Q96D96 273 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 ANO10Q9NW15 660 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 UBE4BO95155 1302 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 DENND3A2RUS2 1198 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 PRCPP42785 496 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 EFNA5P52803 228 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 MLKLQ8NB16 471 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R2P41236 205 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms