RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.62■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.62■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.62■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 PIDD1Q9HB75 910 aa18.62■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 COL4A2P08572 1712 aa18.62■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEB2O15479 319 aa18.61■□□□□ 0.57
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SPCS1-201ENST00000233025 CEP55Q53EZ4 464 aa18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SWSAP1Q6NVH7 229 aa18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.61■□□□□ 0.57
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SPCS1-201ENST00000233025 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 PHKBQ93100 1093 aa18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MYL10Q9BUA6 226 aa18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CHST12Q9NRB3 414 aa18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa18.61■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
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SPCS1-201ENST00000233025 SOBPA7XYQ1 873 aa18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 DDHD2O94830 711 aa18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 EFEMP2O95967 443 aa18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SMARCA1P28370 1054 aa18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 KIF5BP33176 963 aa18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 AAMPQ13685 434 aa18.6■□□□□ 0.57
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SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 LY9Q9HBG7 655 aa18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MARCH5Q9NX47 278 aa18.6■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SHISA7A6NL88 538 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MEIS1O00470 390 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TM4SF5O14894 197 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
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SPCS1-201ENST00000233025 C1QTNF9P0C862 333 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31D3P0C874 917 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 PFKPQ01813 784 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TAS1R1Q7RTX1 841 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RILPL2Q969X0 211 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CDH7Q9ULB5 785 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.59■□□□□ 0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.59■□□□□ 0.57
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SPCS1-201ENST00000233025 FSHRP23945 695 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TMOD1P28289 359 aa18.58■□□□□ 0.56
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SPCS1-201ENST00000233025 NRLP54845 237 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IL31Q6EBC2 164 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa18.58■□□□□ 0.56
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SPCS1-201ENST00000233025 MTSS1LQ765P7 747 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 CATIPQ7Z7H3 387 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 MAP4K1Q92918 833 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NELL2Q99435 816 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K14Q99558 947 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM175Q9BSA9 504 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LOC400499M0QZD8 3231 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LAMA5O15230 3695 aa18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa18.57■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NRP1O14786 923 aa18.57■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF623O75123 536 aa18.57■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.57■□□□□ 0.56
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SPCS1-201ENST00000233025 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
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SPCS1-201ENST00000233025 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.57■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.57■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IGSF10Q6WRI0 2623 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ERICH2A1L162 156 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TGM5O43548 720 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 RAB27AP51159 221 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 DSG1Q02413 1049 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NUCB1Q02818 461 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ADCY1Q08828 1119 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF687Q8N1G0 1237 aa18.56■□□□□ 0.56
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