RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ErmapQ9JLN5 566 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grk1Q9WVL4 564 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NynrinQ5DTZ0 1840 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap221A9Q751 836 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm38392E9Q2A2 434 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb6eI7HJI3 429 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd68P31996 326 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ephb2P54763 986 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc8a1P70414 970 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 YdjcQ14BV6 310 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Miga1Q4QQM5 600 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MaeaQ4VC33 396 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Retreg2Q6NS82 541 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 E2f7Q6S7F2 904 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uts2bQ765I1 113 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf18Q810A1 556 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rusc1Q8BG26 893 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8C6G1 249 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd9Q8C726 612 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl36Q8R124 613 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lman1Q9D0F3 517 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Armc9Q9D2I5 817 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpatch1Q9DBM1 930 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nudt12Q9DCN1 462 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpb2Q9JHH6 422 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptf1aQ9QX98 324 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5936A2BG95 728 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5640A3KG49 728 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myo1eE9Q634 1107 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pex5O09012 639 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Diaph2O70566 1098 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Parp2O88554 559 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il13ra2O88786 383 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtus1Q5HZI1 1210 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CcnjlQ5SRT8 387 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cnot7Q60809 285 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nlrp4fQ66X05 959 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ggt6Q6PDE7 497 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C2cd2lQ80X80 706 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BGC1 442 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lmo3Q8BZL8 145 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim47Q8C0E3 641 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Riox2Q8CD15 465 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cwf19l1Q8CI33 537 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ago4Q8CJF8 861 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Thumpd2Q9CZB3 528 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col11a2Q64739 1736 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col1a1P11087 1453 aa7.1□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp266E9Q2S7 604 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rap1gds1E9Q912 607 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyth3O08967 399 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk14O35495 469 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GcP21614 476 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3r1P26450 724 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3caP42337 1068 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GmncQ3URY2 333 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf652Q5DU09 608 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brip1Q5SXJ3 1174 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ChukQ60680 745 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adat2Q6P6J0 191 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Reep2Q8VCD6 254 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NcaldQ91X97 193 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc5Q99LG4 440 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CalcbQ99MP3 130 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dph6Q9CQ28 267 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap53Q9D439 514 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eid1Q9DCR4 169 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rabgef1Q9JM13 491 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt17Q9QWL7 433 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubr3Q5U430 1889 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4907B1AXB9 411 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2b9P12790 491 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bmp2P21274 394 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OatP29758 439 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp3caP63328 521 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Siah1bQ06985 282 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf113a2Q14B01 337 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem120bQ3TA38 339 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim80Q3V061 624 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taok1Q5F2E8 1001 aa7.09□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vav2Q60992 868 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.4 ms