RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pex1Q5BL07 1284 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Has1Q61647 583 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apol10aQ8CCA5 318 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smg8Q8VE18 991 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MiosQ8VE19 875 aa25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc112A0AUP1 442 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc188F6WEU2 249 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm10134F6ZQC6 126 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpinb3aG3X9V8 387 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PargO88622 969 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pkn1P70268 946 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nsun7Q14AW5 724 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd163Q2VLH6 1121 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dzip3Q7TPV2 1204 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rexo1Q7TT28 1213 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpc3Q8CFZ4 579 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Foxe1Q8R2I0 371 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fuca2Q99KR8 461 aa24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apol7aB2RT54 418 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Orc4O88708 433 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif3aP28741 701 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp13Q5BKP2 858 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asap3Q5U464 904 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp17laQ61068 526 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nrg1Q6DR99 700 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vwa2Q70UZ7 791 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr119Q7TRJ5 321 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Proser3Q7TSA6 634 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trit1Q80UN9 467 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AarsQ8BGQ7 968 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Metap1Q8BP48 386 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Inpp5fQ8CDA1 1132 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phldb2Q8K1N2 1249 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B4galt3Q91YY2 395 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 QpctQ9CYK2 362 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sept3Q9Z1S5 350 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Irs2P81122 1321 aa24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ect2lA0A140LIP2 953 aa24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcl7cO08664 217 aa24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Exoc4O35382 975 aa24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tatdn3Q3U1C6 294 aa24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Camsap3Q80VC9 1252 aa24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q9D5Q8 446 aa24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa24.97■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep350E9Q309 3095 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spocd1B1ASB6 936 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rsph10bE9PYQ0 876 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm11236J3QMS7 360 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpinb8O08800 374 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EnahQ03173 802 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dennd1bQ3U1T9 766 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef16Q3U5C8 713 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr18Q4VBE8 431 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctdspl2Q8BG15 465 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc66Q8K0B3 872 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ugt2b1Q8R084 529 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q91WD4 421 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mis18aQ9CZJ6 204 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef7Q9ES28 862 aa24.96■■□□□ 1.59
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PcntP48725 2898 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r121A2BE32 847 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Heatr4E9Q357 955 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp358E9Q8M1 571 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rsad1Q5SUV1 442 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif2bQ8C0N1 668 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 E2f4Q8R0K9 410 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr532Q8VGT4 309 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hps3Q91VB4 1002 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plagl2Q925T4 496 aa24.95■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnt2D3Z649 1135 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clca3bE9PUL3 1044 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dapk3O54784 448 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Camk4P08414 469 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ercc5P35689 1170 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Paxbp1P58501 919 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr538Q7TRT5 310 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Qsox1Q8BND5 748 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phka2Q8BWJ3 1235 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kct2Q8K201 259 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BrdtQ91Y44 956 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd2bp2Q9CWK3 342 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gyg1Q9R062 333 aa24.94■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stat5aP42230 793 aa24.93■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snx25Q3ZT31 840 aa24.93■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sycp1Q62209 993 aa24.93■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtprjQ64455 1238 aa24.93■■□□□ 1.58
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.8 ms