RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmod4Q9JLH8 345 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tlr2Q9QUN7 784 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmed2Q9R0Q3 201 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lonrf2B2RT44 518 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Scgb2b7D3YYY1 112 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm3095E9Q058 166 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AoahO35298 574 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CopeO89079 308 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gsta4P24472 222 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wfs1P56695 890 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rhox12Q4TU81 186 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp13a3Q5XF89 1219 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 E2f5Q61502 335 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Crybg3Q80W49 1005 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fsd1lQ8BYN5 507 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pop1Q8K205 1045 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tekt2Q922G7 430 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ifi202Q9R002 445 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Serpinb6cW4VSP4 379 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam129cD3YZB0 591 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Aknad1E9Q8N6 675 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Serpina1aP07758 413 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ArP19091 899 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Serpina1cQ00896 412 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Serpina1dQ00897 413 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klhdc9Q3USL1 350 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 OplahQ8K010 1288 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spire2Q8K1S6 718 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Plekhg6Q8R0J1 787 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dqx1Q924H9 718 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 IscuQ9D7P6 168 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rilpl1Q9JJC6 406 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SynrgQ5SV85 1306 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 EvplQ9D952 2035 aa10.05□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrch1P62046 709 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fgfr4Q03142 799 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Psg29Q3URN6 468 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vav2Q60992 868 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 FdxrQ61578 494 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Oca2Q62052 833 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Xlr3bQ6P205 226 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf76Q8BMU0 568 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gpr180Q8BPS4 441 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam118bQ8C569 351 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vmn1r199Q8R280 367 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pde6cQ91ZQ1 861 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Jag1Q9QXX0 1218 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc6D3YZP9 469 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pik3r1P26450 724 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rbm46P86049 533 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nlrp4fQ66X05 959 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm2163Q6PCY5 473 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tas2r134Q7TQB0 298 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Enoph1Q8BGB7 257 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kirrel3Q8BR86 778 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Serpinb13Q8CDC0 389 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam20aQ8CID3 541 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ero1aQ8R180 464 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trappc3O55013 180 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klc1O88447 541 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Akr1b8P45377 316 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pkn1P70268 946 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfyve27Q3TXX3 415 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Palb2Q3U0P1 1104 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp1r1bQ60829 194 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Scfd2Q8BTY8 684 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tti1Q91V83 1085 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kcnh7Q9ER47 1195 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tfr2Q9JKX3 798 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ecel1Q9JMI0 775 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Heg1E9Q7X6 1337 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm5737A0A140LI11 423 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm21962L7N280 338 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01734 135 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vcam1P29533 739 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fermt1P59113 677 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Psmc5P62196 406 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LxnP70202 222 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Meis2P97367 477 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wdr41Q3UDP0 460 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gmcl1Q920G9 524 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.5 ms