RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636773.1

CACNB4-233, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,143 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-233	ENST00000636773	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SLIT2	O94813	1529 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	C3	P01024	1663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	POTEB3	A0JP26	581 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	P4HA2	O15460	535 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SASH3	O75995	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SERPINC1	P01008	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FGA	P02671	866 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CLTA	P09496	248 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	KRT5	P13647	590 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NT5C2	P49902	561 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	DNA2	P51530	1060 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	JAK3	P52333	1124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NUCB1	Q02818	461 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	POTEB	Q6S5H4	581 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ALDH2	P05091	517 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	KCNA5	P22460	613 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	HDAC4	P56524	1084 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773		H3BQF6	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ZBTB5	O15062	677 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	HUS1	O60921	280 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GCNT3	O95395	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	SGPL1	O95470	568 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MBD3	O95983	291 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	HOXC6	P09630	235 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	TGFB3	P10600	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PDHB	P11177	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PPM1A	P35813	382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CBX3	Q13185	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PTGDR	Q13258	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	PKP1	Q13835	747 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LRP8	Q14114	963 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-233	ENST00000636773	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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