RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-216ENST00000636652 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 A0A087WZ62 844 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 DENND3A2RUS2 1198 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 MYBP10242 640 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CASP5P51878 434 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 MGAT3Q09327 533 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 BFSP2Q13515 415 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 KIZQ2M2Z5 673 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM26DQ5JW98 314 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ISM2Q6H9L7 571 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 BRCA2P51587 3418 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PITPNM1O00562 1244 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CKBP12277 381 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF445P59923 1031 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 FAAP100Q0VG06 881 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 STIM1Q13586 685 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TNS4Q8IZW8 715 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ADSSL1Q8N142 457 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TBX20Q9UMR3 447 aa14.71□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 K7ERI5 159 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PSMA7O14818 248 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CHRNA1P02708 482 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CLTBP09497 229 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CTSHP09668 335 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PRCPP42785 496 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 STRN3Q13033 797 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 MAPK6Q16659 721 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM187BQ17R55 369 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ACCSQ96QU6 501 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 OSMRQ99650 979 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 FZD8Q9H461 694 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM206Q9H813 350 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TBX21Q9UL17 535 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 GINS2Q9Y248 185 aa14.7□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PRKCBP05771 671 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 SELPP16109 830 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 SQORQ9Y6N5 450 aa14.69□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 KAT6AQ92794 2004 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ACKR2O00590 384 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CAVIN2O95810 425 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PIGRP01833 764 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 HOXD13P35453 343 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 KCNA1Q09470 495 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 USP38Q8NB14 1042 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms